该联盟的运作模式与印度板球超级联赛(Twenty20 cricket Indian Premier league)和美国职业足球大联盟(Major league Soccer)类似。与世界上绝大多数的足球联盟不同,ISL 不使用升级和降级制度。采用了美国式的特许经营体系,专门创建了 10 支球队参与联盟。每支球队都是由 I 联赛或州联赛的球员组成。
这是一个封闭联盟,只有 8 支球队,分别为加尔各答竞技、钦奈巨人、德里迪纳摩、果阿、喀拉拉爆破手、孟买城、东北联、浦那城,都是来自于经济发达、足球文化相对浓厚的城市。国内球员主要是依靠选秀。
赛制上,印超联赛类似于 NBA,分为季前赛和季后赛,根据对战积分排名进四退四,前四名进入季后赛争夺冠军。值得一提的是,印超每年都会举行选秀大会,由印度足协请来大牌球星,然后各个球队根据签位挑选意中人,最后协商分配。